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Dibenzo[a,h]anthracene (T3D0015)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 2.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2009-03-06 18:57:55 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2014-12-24 20:20:52 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accession Number | T3D0015 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Dibenzo[a,h]anthracene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Small Molecule | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Dibenzo(a,h)anthracene is one of over 100 different polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs). PAHs are chemicals that are formed during the incomplete burning organic substances, such as fossil fuels. They are usually found as a mixture containing two or more of these compounds. It is one ingredient of cigarette. (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compound Type |
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| Chemical Structure |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C22H14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Mass | 278.347 g/mol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 278.110 g/mol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 53-70-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | pentacyclo[12.8.0.0^{3,12}.0^{4,9}.0^{15,20}]docosa-1,3,5,7,9,11,13,15,17,19,21-undecaene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | pentacyclo[12.8.0.0^{3,12}.0^{4,9}.0^{15,20}]docosa-1,3,5,7,9,11,13,15,17,19,21-undecaene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | C1=CC=C2C(C=CC3=CC4=C(C=CC5=CC=CC=C45)C=C23)=C1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C22H14/c1-3-7-19-15(5-1)9-11-17-14-22-18(13-21(17)19)12-10-16-6-2-4-8-20(16)22/h1-14H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | InChIKey=LHRCREOYAASXPZ-UHFFFAOYSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as phenanthrenes and derivatives. These are polycyclic compounds containing a phenanthrene moiety, which is a tricyclic aromatic compound with three non-linearly fused benzene. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Benzenoids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Phenanthrenes and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Phenanthrenes and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aromatic homopolycyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Origin | Exogenous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biofluid Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Applications | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Roles | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Roles | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Appearance | Colorless solid. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties |
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| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra |
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| Toxicity Profile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Route of Exposure | Oral (4) ; inhalation (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mechanism of Toxicity | The ability of PAH's to bind to blood proteins such as albumin allows them to be transported throughout the body. Many PAH's induce the expression of cytochrome P450 enzymes, especially CYP1A1, CYP1A2, and CYP1B1, by binding to the aryl hydrocarbon receptor or glycine N-methyltransferase protein. These enzymes metabolize PAH's into their toxic intermediates. The reactive metabolites of PAHs (epoxide intermediates, dihydrodiols, phenols, quinones, and their various combinations) covalently bind to DNA and other cellular macromolecules, initiating mutagenesis and carcinogenesis. The main carcinogenic metabolite of benzo(a)pyrene is the diol-epoxide trans-9,10-epoxy-7,8-dihydrodiol. (4, 5, 2, 3) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolism | PAH metabolism occurs in all tissues, usually by cytochrome P-450 and its associated enzymes. PAHs are metabolized into reactive intermediates, which include epoxide intermediates, dihydrodiols, phenols, quinones, and their various combinations. The phenols, quinones, and dihydrodiols can all be conjugated to glucuronides and sulfate esters; the quinones also form glutathione conjugates. (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Toxicity Values | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lethal Dose | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Carcinogenicity (IARC Classification) | 2A, probably carcinogenic to humans. (6) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Uses/Sources | PAHs are released into the environment via the combustion of fossil fuels, coke oven emissions and vehicle exhausts, as well as naturally from forest fires and volcanic eruptions. PAHs from these sources may contaminate nearly water systems. They are also found in coal tar and charbroiled food. (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Minimum Risk Level | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects | PAHs are carcinogens and have been associated with the increased risk of skin, respiratory tract, bladder, stomach, and kidney cancers. They may also cause reproductive effects and depress the immune system. (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Symptoms | Acute exposure to PAHs causes irritation and inflammation of the skin and lung tissue. (1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Treatment | There is no known antidote for PAHs. Exposure is usually handled with symptomatic treatment. (4) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound ID | 5889 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL ID | CHEMBL1346946 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChemSpider ID | 5678 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG ID | C14325 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProt ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMIM ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 35299 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD ID | C026486 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stitch ID | Dibenzo[a,h]anthracene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ACToR ID | 412 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MSDS | T3D0015.pdf | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References |
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| Gene Regulation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Up-Regulated Genes |
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| Down-Regulated Genes |
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Targets
- General Function:
- Transcription regulatory region dna binding
- Specific Function:
- Ligand-activated transcriptional activator. Binds to the XRE promoter region of genes it activates. Activates the expression of multiple phase I and II xenobiotic chemical metabolizing enzyme genes (such as the CYP1A1 gene). Mediates biochemical and toxic effects of halogenated aromatic hydrocarbons. Involved in cell-cycle regulation. Likely to play an important role in the development and maturation of many tissues. Regulates the circadian clock by inhibiting the basal and circadian expression of the core circadian component PER1. Inhibits PER1 by repressing the CLOCK-ARNTL/BMAL1 heterodimer mediated transcriptional activation of PER1.
- Gene Name:
- AHR
- Uniprot ID:
- P35869
- Molecular Weight:
- 96146.705 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 0.07 uM | ATG_Ahr_CIS | Attagene |
| AC50 | 0.07 uM | Tox21_AhR | Tox21/NCGC |
References
- Uno S, Dragin N, Miller ML, Dalton TP, Gonzalez FJ, Nebert DW: Basal and inducible CYP1 mRNA quantitation and protein localization throughout the mouse gastrointestinal tract. Free Radic Biol Med. 2008 Feb 15;44(4):570-83. Epub 2007 Nov 12. [17997381 ]
- Padros J, Pelletier E: In vivo formation of (+)-anti-benzo[a]pyrene diol-epoxide-plasma albumin adducts in fish. Mar Environ Res. 2000 Jul-Dec;50(1-5):347-51. [11460716 ]
- Xu H, Rajesan R, Harper P, Kim RB, Lonnerdal B, Yang M, Uematsu S, Hutson J, Watson-MacDonell J, Ito S: Induction of cytochrome P450 1A by cow milk-based formula: a comparative study between human milk and formula. Br J Pharmacol. 2005 Sep;146(2):296-305. [15997229 ]
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- ATSDR - Agency for Toxic Substances and Disease Registry (1995). Toxicological profile for PAHs. U.S. Public Health Service in collaboration with U.S. Environmental Protection Agency (EPA). [Link]
- Wikipedia. Benzopyrene. Last Updated 22 January 2009. [Link]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- Steroid hormone receptors are ligand-activated transcription factors that regulate eukaryotic gene expression and affect cellular proliferation and differentiation in target tissues. Transcription factor activity is modulated by bound coactivator and corepressor proteins. Transcription activation is down-regulated by NR0B2. Activated, but not phosphorylated, by HIPK3 and ZIPK/DAPK3.
- Gene Name:
- AR
- Uniprot ID:
- P10275
- Molecular Weight:
- 98987.9 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 1.53 uM | Tox21_AR_LUC_MDAKB2_Agonist | Tox21/NCGC |
References
- Vinggaard AM, Hnida C, Larsen JC: Environmental polycyclic aromatic hydrocarbons affect androgen receptor activation in vitro. Toxicology. 2000 Apr 14;145(2-3):173-83. [10771140 ]
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
3. DNA
- General Function:
- Used for biological information storage.
- Specific Function:
- DNA contains the instructions needed for an organism to develop, survive and reproduce.
- Molecular Weight:
- 2.15 x 1012 Da
References
- Uno S, Dragin N, Miller ML, Dalton TP, Gonzalez FJ, Nebert DW: Basal and inducible CYP1 mRNA quantitation and protein localization throughout the mouse gastrointestinal tract. Free Radic Biol Med. 2008 Feb 15;44(4):570-83. Epub 2007 Nov 12. [17997381 ]
- Padros J, Pelletier E: In vivo formation of (+)-anti-benzo[a]pyrene diol-epoxide-plasma albumin adducts in fish. Mar Environ Res. 2000 Jul-Dec;50(1-5):347-51. [11460716 ]
- ATSDR - Agency for Toxic Substances and Disease Registry (1995). Toxicological profile for PAHs. U.S. Public Health Service in collaboration with U.S. Environmental Protection Agency (EPA). [Link]
- Wikipedia. Benzopyrene. Last Updated 22 January 2009. [Link]
- General Function:
- Glycine n-methyltransferase activity
- Specific Function:
- Catalyzes the methylation of glycine by using S-adenosylmethionine (AdoMet) to form N-methylglycine (sarcosine) with the concomitant production of S-adenosylhomocysteine (AdoHcy). Possible crucial role in the regulation of tissue concentration of AdoMet and of metabolism of methionine.
- Gene Name:
- GNMT
- Uniprot ID:
- Q14749
- Molecular Weight:
- 32742.0 Da
References
- Uno S, Dragin N, Miller ML, Dalton TP, Gonzalez FJ, Nebert DW: Basal and inducible CYP1 mRNA quantitation and protein localization throughout the mouse gastrointestinal tract. Free Radic Biol Med. 2008 Feb 15;44(4):570-83. Epub 2007 Nov 12. [17997381 ]
- Padros J, Pelletier E: In vivo formation of (+)-anti-benzo[a]pyrene diol-epoxide-plasma albumin adducts in fish. Mar Environ Res. 2000 Jul-Dec;50(1-5):347-51. [11460716 ]
- ATSDR - Agency for Toxic Substances and Disease Registry (1995). Toxicological profile for PAHs. U.S. Public Health Service in collaboration with U.S. Environmental Protection Agency (EPA). [Link]
- Wikipedia. Benzopyrene. Last Updated 22 January 2009. [Link]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- Nuclear receptor that binds DNA as a monomer to ROR response elements (RORE) containing a single core motif half-site 5'-AGGTCA-3' preceded by a short A-T-rich sequence. Key regulator of cellular differentiation, immunity, peripheral circadian rhythm as well as lipid, steroid, xenobiotics and glucose metabolism. Considered to have intrinsic transcriptional activity, have some natural ligands like oxysterols that act as agonists (25-hydroxycholesterol) or inverse agonists (7-oxygenated sterols), enhancing or repressing the transcriptional activity, respectively. Recruits distinct combinations of cofactors to target gene regulatory regions to modulate their transcriptional expression, depending on the tissue, time and promoter contexts. Regulates the circadian expression of clock genes such as CRY1, ARNTL/BMAL1 and NR1D1 in peripheral tissues and in a tissue-selective manner. Competes with NR1D1 for binding to their shared DNA response element on some clock genes such as ARNTL/BMAL1, CRY1 and NR1D1 itself, resulting in NR1D1-mediated repression or RORC-mediated activation of the expression, leading to the circadian pattern of clock genes expression. Therefore influences the period length and stability of the clock. Involved in the regulation of the rhythmic expression of genes involved in glucose and lipid metabolism, including PLIN2 and AVPR1A. Negative regulator of adipocyte differentiation through the regulation of early phase genes expression, such as MMP3. Controls adipogenesis as well as adipocyte size and modulates insulin sensitivity in obesity. In liver, has specific and redundant functions with RORA as positive or negative modulator of expression of genes encoding phase I and Phase II proteins involved in the metabolism of lipids, steroids and xenobiotics, such as SULT1E1. Also plays also a role in the regulation of hepatocyte glucose metabolism through the regulation of G6PC and PCK1. Regulates the rhythmic expression of PROX1 and promotes its nuclear localization (By similarity). Plays an indispensable role in the induction of IFN-gamma dependent anti-mycobacterial systemic immunity (PubMed:26160376).Isoform 2: Essential for thymopoiesis and the development of several secondary lymphoid tissues, including lymph nodes and Peyer's patches. Required for the generation of LTi (lymphoid tissue inducer) cells. Regulates thymocyte survival through DNA-binding on ROREs of target gene promoter regions and recruitment of coactivaros via the AF-2. Also plays a key role, downstream of IL6 and TGFB and synergistically with RORA, for lineage specification of uncommitted CD4(+) T-helper (T(H)) cells into T(H)17 cells, antagonizing the T(H)1 program. Probably regulates IL17 and IL17F expression on T(H) by binding to the essential enhancer conserved non-coding sequence 2 (CNS2) in the IL17-IL17F locus. May also play a role in the pre-TCR activation cascade leading to the maturation of alpha/beta T-cells and may participate in the regulation of DNA accessibility in the TCR-J(alpha) locus.
- Gene Name:
- RORC
- Uniprot ID:
- P51449
- Molecular Weight:
- 58194.845 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 0.40 uM | ATG_RORg_TRANS | Attagene |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Atp binding
- Specific Function:
- Involved in DNA damage response. Involved in a RAD9A-related damage checkpoint, a pathway that is important in determining whether DNA damage is compatible with cell survival or whether it requires cell elimination by apoptosis. Modulates the RAD9A interaction with BCL2 and thereby induces DNA damages-induced apoptosis.
- Gene Name:
- ATAD5
- Uniprot ID:
- Q96QE3
- Molecular Weight:
- 207568.185 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 0.77 uM | Tox21_ELG1_LUC_Agonist | Tox21/NCGC |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- Nuclear hormone receptor. The steroid hormones and their receptors are involved in the regulation of eukaryotic gene expression and affect cellular proliferation and differentiation in target tissues. Ligand-dependent nuclear transactivation involves either direct homodimer binding to a palindromic estrogen response element (ERE) sequence or association with other DNA-binding transcription factors, such as AP-1/c-Jun, c-Fos, ATF-2, Sp1 and Sp3, to mediate ERE-independent signaling. Ligand binding induces a conformational change allowing subsequent or combinatorial association with multiprotein coactivator complexes through LXXLL motifs of their respective components. Mutual transrepression occurs between the estrogen receptor (ER) and NF-kappa-B in a cell-type specific manner. Decreases NF-kappa-B DNA-binding activity and inhibits NF-kappa-B-mediated transcription from the IL6 promoter and displace RELA/p65 and associated coregulators from the promoter. Recruited to the NF-kappa-B response element of the CCL2 and IL8 promoters and can displace CREBBP. Present with NF-kappa-B components RELA/p65 and NFKB1/p50 on ERE sequences. Can also act synergistically with NF-kappa-B to activate transcription involving respective recruitment adjacent response elements; the function involves CREBBP. Can activate the transcriptional activity of TFF1. Also mediates membrane-initiated estrogen signaling involving various kinase cascades. Isoform 3 is involved in activation of NOS3 and endothelial nitric oxide production. Isoforms lacking one or several functional domains are thought to modulate transcriptional activity by competitive ligand or DNA binding and/or heterodimerization with the full length receptor. Essential for MTA1-mediated transcriptional regulation of BRCA1 and BCAS3. Isoform 3 can bind to ERE and inhibit isoform 1.
- Gene Name:
- ESR1
- Uniprot ID:
- P03372
- Molecular Weight:
- 66215.45 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 9.67 uM | Tox21_ERa_BLA_Agonist_ratio | Tox21/NCGC |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]